PRÉMATURITÉ : Ces bactéries qui pourraient l’expliquer

Gardnerella est un groupe de bactéries anaérobies que l'on trouve couramment dans le microbiome vaginal.

Cependant, des niveaux plus élevés de ces bactéries signent la présence d’une vaginose bactérienne et sont également associés à un risque plus élevé d'accouchement prématuré. Plus généralement, le microbiome vaginal est dominé par une espèce de Lactobacillus, ce qui crée un environnement qui exclut les autres bactéries.

L’équipe tente ici de mieux cerner les effets de cette espèce bactérienne Gardnerella « très diversifiée », précise l’un des auteurs principaux, le Dr Ben Callahan, professeur agrégé de santé des populations et de pathobiologie. « Les scientifiques n’ont commencé que récemment à examiner les espèces individuelles de Gardnerella, nous ne savons donc pas encore si différentes espèces pourraient avoir des effets différents sur la santé ».

Le défi unique posé par le séquençage du microbiome vaginal est que tous les prélèvements comprendront principalement de l’ADN de l’hôte, ce qui rend l’extraction des données microbiennes à la fois longue et coûteuse. L’équipe a donc d’abord établi une méthodologie permettant d’identifier les différentes espèces de Gardnerella. En effet, ajoute un autre auteur, Hanna Berman, chercheur à la NC State : « les outils dont nous disposons, à l’heure actuelle, pour étudier le microbiome vaginal vont considérer toutes les bactéries Gardnerella comme une même espèce ». En clair, les chercheurs ont dû créer leur propre base de données des génomes de Gardnerella et concevoir une méthode pour identifier les différentes espèces de Gardnerella.